En 1937, un arrêté prévoit une croisière d'endurance pour tester les hommes et le matériel. Le Conquérant et le Tonnant iront en Extrême-Orient.

Le 01 Mai 1938, il appareille de Toulon pour un séjour en Indochine qui se déroule de Mai à Octobre 1938.

Le 15 Décembre 1938, il regagne Toulon.

Le 01 Septembre 1939, Le Conquérant fait partie de la 1ère D.S.M. de la 3ème Escadrille de la 1ère Flottille de la 2ème Escadre à Toulon. Il est avec Le Héros, Le Glorieux et Le Tonnant.

Le 20 Juin 1940, il est disponible avec des sous-marins de la 1ère, 3ème et 17ème D.S.M.. Ces bateaux sont envoyés à tour de rôle en alerte aux Salins.

Le 25 Juin 1940, il fait partie de la 1ère D.S.M. basée à Toulon avec le Héros, le Glorieux et le Tonnant.

Le 03 Juillet 1940, jour de l'attaque par les britanniques de Mers-el-Kébir, il fait partie du groupe A avec l'Espoir et l'Archimède. Ils reçoivent l'ordre de rallier Oran. Un autre groupe, le B, formé par l'Iris, la Vénus, la Sultane, la Sirène, le Pallas et la Cérés reçoivent le même ordre. Il est à noter qu'à bord du Conquérant, trois marins, J. Boudier, A. Hamounou et J. Guillmont tentent de rallier la France Libre par le Maroc espagnol; ils sont faits prisonniers et condamnés par le tribunal militaire de Casablanca à un an de prison pour « désertion ».

Le groupe A doit former, dans la nuit du 06 au 07 Juillet 1940, un barrage orienté Nord-Sud à 20 nautiques dans l'Est de l'île d'Alborán. Il appareille le 04 Juillet 1940 à 02h45 à 15 nœuds. Il reçoit l'ordre de rentrer à Toulon le jour suivant.

Le 01 Janvier 1942, il fait partie de la 4ème D.S.M. avec le Tonnant et l'Aurore.

Le 01 Novembre 1942, le Conquérant fait toujours partie  de la 4ème D.S.M. basée au Maroc avec le Tonnant.

Le 06 Novembre 1942, il entre au dock pour carénage jusqu'à début Décembre.

Le 08 Novembre 1942 à 06h15, les porte-avions U.S.S. "Ranger" et "Suwanne" font décoller leurs appareils et à 07h10 les bombardiers "Helldiver" attaquent le port de Casablanca pendant l'Opération "Torch".